dovetailgenomics 21006说明书

Dovetail™ Micro-C Kit在邻近连接之前使用微球菌核酸酶 ( MNase ) 进行染色质消化。该试剂盒提供了在生成 NGS 文库之前对哺乳动物样本进行邻近连接步骤所需的所有试剂。该试剂盒与用于 Illumina 的 Dovetail™ 文库模块（货号 #25004）和用于 Illumina 测序的第 3 方标准双端文库制备试剂盒兼容。

Dovetail Micro-C 套件具有以下主要优点：

• 与序列无关的染色质片段化甚至可以在全基因组范围内检测染色质接触（使用基于限制性酶的 Hi-C 方法无法覆盖多达 20% 的基因组）

• 染色质接触的超高核小体水平分辨率

• 最高的信噪比数据，同时丰富了远程信息读取和核小体保护片段

Dovetail Micro-C 库丰富了所需的 Hi-C 特性

所述MNase酶既具有不依赖序列的内切核酸酶和外切核酸酶活所以产生的片段是核小体的长度（146碱基对）。该协议的邻近结扎部分经过优化，以最大限度地提高远程交互。由此产生的高度均匀的短片段能够实现染色质接触的核小体水平分辨率，这是理论分辨率的最大值。

改进的拓扑特征调用

在邻近连接数据中检测更高阶特征（例如染色质环）的能力取决于丰富远程信息读取以捕获染色质相互作用频率。与基于 RE 的方法相比，增加的染色体构象信息读取结合超高分辨率改善了循环调用。

Dovetail Micro-C *地捕捉核小体定位

用MNase消化的染色质显示了在 Dovetail™ Micro-C 文库中可见的全基因组核小体图谱。该图由与受核小体保护的 DNA 相关的序列读取峰和代表可被MNase消化的干预 DNA 的谷组成。这种振荡发生在 ~146 bp 的频率（包裹在单核小体周围的 DNA 长度）。此功能是 Micro-C 数据的，因为它在基于 RE 的方法中不存在。Dovetail™ Micro-C 实现的全基因组核小体定位和超分辨率染色体拓扑结构相结合，有助于从核小体到核小体染色质接触的映射。

Dovetail Genomics 是一家位于圣克鲁斯的初创生命科学公司，致力于开发基因组学技术，以改善基因组组装、揭示关键的结构变异信息以及基因组学中的许多其他令人兴奋的应用。

dovetailgenomics 21007说明书

Dovetail™ HiChIP MNase Kit 结合了 ChIP-seq 和 Hi-C 的优点，Hi-C 是一种邻近连接方法，使用标准的 Illumina 双端测序捕获长距离相互作用，使研究人员能够查询由特定蛋白质介导的蛋白质定向染色质构象。兴趣。
除抗体外，该试剂盒提供了在生成 NGS 文库之前对哺乳动物样本进行染色质免疫沉淀和邻近连接步骤所需的所有试剂。该试剂盒与用于 Illumina 的 Dovetail™ 文库模块（货号 #25004）和用于 Illumina 测序的第 3 方标准双端文库制备试剂盒兼容。

Dovetail HiChIP Kit 具有以下主要优势：

• 在单个库中同时捕获 ChIP-seq 和 Hi-C 数据

• 推出更多即用型抗体

• 以核小体水平分辨率绘制染色质相互作用图

从样品到测序就绪文库的简单三天工作流程

与其他类似方法相比，Dovetail HiChIP 工作流程具有多项优势：

• 染色质的酶促和均匀裂解

• 来自邻近结扎的远程信息的丰富

• 稳健性和重现性低至一百万个细胞输入

• 经验证的常见抗体清单

Dovetail™ Micro-C Proximity Ligation Assay 与 Dovetail HiChIP 方法的*组合使使用微球菌核酸酶 ( MNase ) 能够在邻近连接之前均匀地分割染色质，没有序列偏差，消除了对精细超声处理程序的需要，并提供了染色质相互作用的最大分辨率（低至单核小体大小）。

绘制蛋白质结合位点和长程蛋白质定向相互作用

Dovetail HiChIP Kit 能够研究蛋白质导向的 3-D 染色质相互作用。与 ChIP-seq 类似，Dovetail HiChIP 数据捕获由目标蛋白质直接结合的序列。然而，还捕获了由感兴趣的蛋白质介导的其他远程相互作用。在测定中使用MNase 会产生核小体分辨率数据。

以较少的顺序生成高分辨率的接触图

蛋白质导向染色质特征的富集使高分辨率接触图生成成为可能，但读取深度更小。与基于高分辨率限制性内切酶的 Hi-C 相比，Dovetail HiChIP 数据能够以读取深度的一小部分显示高阶染色质特征，例如环和染色质相互作用，从而显着节省测序成本。