DNA甲基化建库试剂盒V2(Methyl-seq DNA Library Prep Kit)

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FAQ

COA

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Hieff NGS® Methyl-seq DNA Library Prep Kit for Illumina V2是针对Illumina®测序平台专业开发设计的新一代DNA甲基化建库试剂盒,在前一代建库试剂盒的基础上,改善了接头连接效率,并采用了更加新型的高保真酶,显著提高扩增均一性和保真性。适用于各种经Bisulfite处理的样本类型,包括gDNA、FFPE DNA、cell free DNA (cfDNA)、ChIP DNA等,可以满足Bisulfite处理后的10 pg~250 ng DNA样本建库。该试剂盒可兼容短至40 bp的DNA样本。本产品不仅更加经济,同时也提供了简便快速的建库流程,一般在2小时左右可以完成正常建库。

 

运输与保存方法

冰袋运输。所有组分-20 °C保存,有效期1年。

 

注意事项

一、关于操作

1. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

2. 请于使用前将试剂盒各组分置于室温解冻。解冻后上下颠倒数次充分混匀,短暂离心后置于冰上待用。

3. 配制各步骤反应液时推荐使用移液器吹打混匀或轻轻振荡,剧烈振荡可能会造成文库产出下降。

4. 为避免样品交叉污染,推荐使用带滤芯的枪头,吸取不同样品时请更换枪头。

5. 推荐在带热盖的PCR仪中进行各步骤反应,使用前应预热PCR仪至反应温度附近。

6. PCR产物因操作不当极容易产生气溶胶污染,进而影响实验结果准确性。推荐将PCR反应体系配制区和PCR产物纯化检测区进行强制性的物理隔离;使用专用的移液器等设备;并定时对各实验区域进行清洁(使用0.5%次氯酸钠或10%漂白剂进行擦拭清理),以保证实验环境的洁净度。

7. 本产品仅作科研用途!

 

案例展示

a. gDNA样本建库示例

DNA甲基化建库试剂盒V2(Methyl-seq DNA Library Prep Kit)

 2:human gDNA 样本 bisulfite 处理后的 Aligent 2100 建库示意图

50 ng human gDNA使用ZYMO EZ DNA Methylation-Gold Kit (D5005)处理后全部投入建库PCR 扩增10 cycle 得到的文库产量约为20×58.2 ng;

b. FFPE DNA样本建库示例

DNA甲基化建库试剂盒V2(Methyl-seq DNA Library Prep Kit)

 3:FFPE DNA 样本bisulfite 处理后的 Aligent 2100 建库示意图

50 ng FFPE DNA 使用ZYMO EZ DNA Methylation-Gold Kit (D5005)处理后全部投入建库PCR 扩增 10 cycle 得到的文库产量约为  20×74.8 ng;

c. cfDNA样本建库示例

DNA甲基化建库试剂盒V2(Methyl-seq DNA Library Prep Kit)

 4:cfDNA 样本 bisulfite 处理后的 Aligent 2100 建库示意图

10ng cfDNA 使用 ZYMO EZ DNA Methylation-Gold Kit (D5005)处理后全部投入建库PCR 扩增 11 cycle 得到的文库产量约为 20×54.4 ng;

 

常见问题

DNA 文库产量偏低,出现接头二聚体,大片段等问题,可以考虑从如下方面进行优化:

  1. a)文库产量偏低,应考虑样本溶液中含有酶抑制剂组分,建议再次纯化;
  2. b)文库出现接头二聚体,推荐在互补链延伸之后进行2轮纯化,在第一轮纯化后用50 μL洗脱,然后加入1.2×beads (60 μL)进行再次纯化;
  3. c)对于文库大片段的出现,考虑是过度扩增引起,可以适当减少扩增循环数。

 

HB230313

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暂无内容

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Hieff NGS® Methyl-seq DNA Library Prep Kit for Illumina V2是针对Illumina®测序平台专业开发设计的新一代DNA甲基化建库试剂盒,在前一代建库试剂盒的基础上,改善了接头连接效率,并采用了更加新型的高保真酶,显著提高扩增均一性和保真性。适用于各种经Bisulfite处理的样本类型,包括gDNA、FFPE DNA、cell free DNA (cfDNA)、ChIP DNA等,可以满足Bisulfite处理后的10 pg~250 ng DNA样本建库。该试剂盒可兼容短至40 bp的DNA样本。本产品不仅更加经济,同时也提供了简便快速的建库流程,一般在2小时左右可以完成正常建库。

 

运输与保存方法

冰袋运输。所有组分-20 °C保存,有效期1年。

 

注意事项

一、关于操作

1. 为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。

2. 请于使用前将试剂盒各组分置于室温解冻。解冻后上下颠倒数次充分混匀,短暂离心后置于冰上待用。

3. 配制各步骤反应液时推荐使用移液器吹打混匀或轻轻振荡,剧烈振荡可能会造成文库产出下降。

4. 为避免样品交叉污染,推荐使用带滤芯的枪头,吸取不同样品时请更换枪头。

5. 推荐在带热盖的PCR仪中进行各步骤反应,使用前应预热PCR仪至反应温度附近。

6. PCR产物因操作不当极容易产生气溶胶污染,进而影响实验结果准确性。推荐将PCR反应体系配制区和PCR产物纯化检测区进行强制性的物理隔离;使用专用的移液器等设备;并定时对各实验区域进行清洁(使用0.5%次氯酸钠或10%漂白剂进行擦拭清理),以保证实验环境的洁净度。

7. 本产品仅作科研用途!

 

案例展示

a. gDNA样本建库示例

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 2:human gDNA 样本 bisulfite 处理后的 Aligent 2100 建库示意图

50 ng human gDNA使用ZYMO EZ DNA Methylation-Gold Kit (D5005)处理后全部投入建库PCR 扩增10 cycle 得到的文库产量约为20×58.2 ng;

b. FFPE DNA样本建库示例

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 3:FFPE DNA 样本bisulfite 处理后的 Aligent 2100 建库示意图

50 ng FFPE DNA 使用ZYMO EZ DNA Methylation-Gold Kit (D5005)处理后全部投入建库PCR 扩增 10 cycle 得到的文库产量约为  20×74.8 ng;

c. cfDNA样本建库示例

DNA甲基化建库试剂盒V2(Methyl-seq DNA Library Prep Kit)

 4:cfDNA 样本 bisulfite 处理后的 Aligent 2100 建库示意图

10ng cfDNA 使用 ZYMO EZ DNA Methylation-Gold Kit (D5005)处理后全部投入建库PCR 扩增 11 cycle 得到的文库产量约为 20×54.4 ng;

 

常见问题

DNA 文库产量偏低,出现接头二聚体,大片段等问题,可以考虑从如下方面进行优化:

  1. a)文库产量偏低,应考虑样本溶液中含有酶抑制剂组分,建议再次纯化;
  2. b)文库出现接头二聚体,推荐在互补链延伸之后进行2轮纯化,在第一轮纯化后用50 μL洗脱,然后加入1.2×beads (60 μL)进行再次纯化;
  3. c)对于文库大片段的出现,考虑是过度扩增引起,可以适当减少扩增循环数。

 

HB230313

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