2×实时定量PCR扩增预混液|Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox)

2×实时定量PCR扩增预混液|Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox)

产品说明书

FAQ

COA

已发表文献

产品描述
本产品是2×实时定量PCR扩增的预混合溶液。采用的抗体法热启动DNA聚合酶(货号:10113ES),在预变性温度(95℃)加热30sec,UNICON® Taq抗体失活,释放出Taq DNA Polymerase活性。抗体法热启动Taq酶可以有效抑制引物非特异性退火导致的扩增。同时,配方优化了有效抑制非特异性PCR扩增的因子和提升PCR反应扩增效率的因子,适合低浓度模板的扩增,使定量PCR可以在宽广的定量区域内获得良好的标准曲线。
Mix中含有Hieff® Taq DNA Polymerase、UNICON® Taq抗体、SYBR Green I、dNTPs、Mg2+及High Rox。使用时,仅需在扩增体系中加入模板和引物即可进行实时荧光定量PCR,大大简化操作过程,降低污染几率。

适用机型
Applied Biosystems: 5700, 7000, 7300, 7700, 7900HT FAST, StepOne, StepOne Plus.

运输与保存方式
冰袋运输。-20℃避光储存,有效期18个月。
本品避免反复冻融。产品中含有荧光染料SYBR Green I,保存或配制反应体系时需避免强光照射。

注意事项

1. 解冻后Master Mix可能出现絮状物质,4℃放置并上下颠倒混匀至溶液澄清,不影响试剂性能。

2. 推荐使用本公司cDNA合成试剂盒(货号:11123ES),以有效去除RNA样品中残留的基因组。

3. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
4. 本产品仅作科研用途!

 

反应体系(推荐冰上配制)

组分

体积(μl)

体积(μl)

终浓度

 

Hieff UNICON® qPCR SYBR® Green Master Mix (抗体法,High Rox)

25

10

Forward Primer (10 μM)

1

0.4

0.2 μM

Reverse Primer (10 μM)

1

0.4

0.2 μM

模板DNA

X

X

无菌超纯水

to 50

to 20

【注】: 使用前务必充分混匀,避免剧烈震荡产生过多气泡。

a) 引物浓度:通常引物终浓度为0.2 μM,也可以根据情况在0.1-1.0 μM之间进行调整。

b) 模板浓度:如模板类型为未稀释cDNA原液,使用体积不应超过qPCR反应总体积的1/10。

c) 模板稀释:cDNA原液建议5-10倍稀释,最佳模板加入量以扩增得到的CT值在20-30个循环为好。

d) 反应体系:推荐使用20 μl或50 μl,以保证目的基因扩增的有效性和重复性。

e) 体系配制:请于超净工作台内配制,并使用无核酸酶残留的枪头、反应管;推荐使用带滤芯的枪头。避免交叉污染和气溶胶污染。

 

     扩增程序(两步法)                           扩增程序(三步法)

循环步骤

温度

时间

循环数

 

循环步骤

温度

时间

循环数

预变性

95℃

30 sec

1

 

预变性

95℃

30 sec

1

变性

95℃

10 sec

40

 

变性

95℃

10 sec

40

退火/延伸

60℃

30 sec★

 

退火

55-60℃

20 sec

         

延伸

72℃

20 sec★

熔解曲线阶段

仪器默认设置

1

 

熔解曲线阶段

仪器默认设置

1

 

【注】高特异性可选择两步法,高效率扩增可选择三步法。

a) 预变性时间:本反应条件适合大多数基因扩增,如果遇到含有复杂结构的基因可适当增加预变性时间至3-5min。

b) 退火温度和时间:请根据引物和目的基因的长度进行调整。

c) 荧光信号采集(★):请按照仪器使用说明书要求进行实验程序设置,几种常见仪器的时间设定如下:

30sec以上:Applied Biosystems: StepOne, StepOne Plus, 7500 Fast;Roche Applied Science: LightCycler 480;Bio-Rad: CFX96

31sec以上:Applied Biosystems: 7300

34sec以上:Applied Biosystems: 7500

d) 熔解曲线:通常情况下可以使用仪器默认程序。

结果分析

定量实验至少需要三个生物学重复。反应结束后需要确认扩增曲线及熔解曲线。

1) 扩增曲线:标准扩增曲线为S型。

Ct值落在20-30之间时,定量分析最准确;

Ct值小于10,需要将稀释模板后,重新进行实验;

Ct值介于30-35之间时,需要提高模板浓度,或者增大反应体系的体积,以提高扩增效率,保证结果分析的准确性;
Ct值大于35时,检测结果无法定量分析基因的表达量,但可用于定性分析。

2) 熔解曲线:

熔解曲线单峰,表明反应特异性好可以进行定量结果分析;若熔解曲线出现双峰或者多峰,则不能进行定量分析。

熔解曲线出现双峰,需要通过DNA琼脂糖凝胶电泳判断非目标峰是引物二聚体还是非特异性扩增。

如果是引物二聚体,建议降低引物浓度,或者重新设计扩增效率高的引物。

如果是非特异性扩增,请提高退火温度,或者重新设计更高特异性的引物。

引物设计指南

1)推荐引物长度25 bp左右。扩增产物长度150 bp为佳,可以在100 bp-300 bp内选择。

2)正向引物和反向引物的Tm值相差不宜超过2℃。引物Tm值60℃-65℃为佳。

3)引物碱基分布要均匀,避免出现连续的4个相同碱基,GC含量控制在50%左右。3’端最后一个碱基最好为G或C。

4)引物内部或者正反两条引物间最好避免出现有3个碱基以上的互补序列。

5)引物特异性需要用NCBI BLAST程序进行核对。避免引物3’端有2个碱基以上的非特异性互补。

6)设计完成的引物需要进行扩增效率的检测,只有具备相同扩增效率的引物才可用于定量比较分析。

相关产品

产品名称

货号

规格

Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis Kit(gDNA digester plus)

11121ES60

100 T

Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(gDNA digester plus) 

11123ES60

100 T

Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(No Rox )

11201ES08

5 mL

Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(Low Rox Plus)

11202ES08

5 mL

Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(High Rox Plus) 

11203ES08

5 mL

Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,No Rox)

11195ES08

5 mL

Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,Low Rox)

11196ES08

5 mL

Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox)

11197ES08

5 mL

Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,No Rox)

11198ES08

5 mL

Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,Low Rox)

11199ES08

5 mL

Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox)

11200ES08

5 mL

 

HB210824

Q:最近做相对定量实验,Ct 值一直在 30 以后,是否可以考虑用这一款产品?

A:可以,这款是高灵敏度的,针对低丰度样本开发优化的。

[1] Yan P, Li Z, Xiong J, et al. LARP7 ameliorates cellular senescence and aging by allosterically enhancing SIRT1 deacetylase activity. Cell Rep. 2021;37(8):110038. doi:10.1016/j.celrep.2021.110038(IF:9.423)
[2] Huang C, Zhang N, Xiong H, et al. Multi-Omics Analysis for Transcriptional Regulation of Immune-Related Targets Using Epigenetic Data: A New Research Direction. Front Immunol. 2022;12:741634. Published 2022 Jan 3. doi:10.3389/fimmu.2021.741634(IF:7.561)
[3] Ni Z, Huang C, Zhao H, et al. PLXNC1: A Novel Potential Immune-Related Target for Stomach Adenocarcinoma. Front Cell Dev Biol. 2021;9:662707. Published 2021 Jul 2. doi:10.3389/fcell.2021.662707(IF:6.684)
[4] Huang C, Huang R, Chen H, et al. Chromatin Accessibility Regulates Gene Expression and Correlates With Tumor-Infiltrating Immune Cells in Gastric Adenocarcinoma. Front Oncol. 2021;10:609940. Published 2021 Jan 5. doi:10.3389/fonc.2020.609940(IF:6.244)
[5] Wang Y, Chen Z, Zhang X, et al. Single-Base Resolution Mapping Reveals Distinct 5-Formylcytidine in Saccharomyces cerevisiae mRNAs. ACS Chem Biol. 2022;17(1):77-84. doi:10.1021/acschembio.1c00633(IF:5.100)
[6] Jian W, Deng XC, Munankarmy A, et al. KIF23 promotes triple negative breast cancer through activating epithelial-mesenchymal transition. Gland Surg. 2021;10(6):1941-1950. doi:10.21037/gs-21-19(IF:2.953)
[7] Lv J, Liu W, Shi G, et al. Human cardiac extracellular matrix-chitosan-gelatin composite scaffold and its endothelialization. Exp Ther Med. 2020;19(2):1225-1234. doi:10.3892/etm.2019.8349(IF:1.448)
[8] Cai Y, Zheng Q, Yao DJ. Phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 is a diagnostic and prognostic biomarker for hepatocellular carcinoma. World J Clin Cases. 2020;8(17):3774-3785. doi:10.12998/wjcc.v8.i17.3774(IF:1.013)

产品描述
本产品是2×实时定量PCR扩增的预混合溶液。采用的抗体法热启动DNA聚合酶(货号:10113ES),在预变性温度(95℃)加热30sec,UNICON® Taq抗体失活,释放出Taq DNA Polymerase活性。抗体法热启动Taq酶可以有效抑制引物非特异性退火导致的扩增。同时,配方优化了有效抑制非特异性PCR扩增的因子和提升PCR反应扩增效率的因子,适合低浓度模板的扩增,使定量PCR可以在宽广的定量区域内获得良好的标准曲线。
Mix中含有Hieff® Taq DNA Polymerase、UNICON® Taq抗体、SYBR Green I、dNTPs、Mg2+及High Rox。使用时,仅需在扩增体系中加入模板和引物即可进行实时荧光定量PCR,大大简化操作过程,降低污染几率。

适用机型
Applied Biosystems: 5700, 7000, 7300, 7700, 7900HT FAST, StepOne, StepOne Plus.

运输与保存方式
冰袋运输。-20℃避光储存,有效期18个月。
本品避免反复冻融。产品中含有荧光染料SYBR Green I,保存或配制反应体系时需避免强光照射。

注意事项

1. 解冻后Master Mix可能出现絮状物质,4℃放置并上下颠倒混匀至溶液澄清,不影响试剂性能。

2. 推荐使用本公司cDNA合成试剂盒(货号:11123ES),以有效去除RNA样品中残留的基因组。

3. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
4. 本产品仅作科研用途!

 

反应体系(推荐冰上配制)

组分

体积(μl)

体积(μl)

终浓度

 

Hieff UNICON® qPCR SYBR® Green Master Mix (抗体法,High Rox)

25

10

Forward Primer (10 μM)

1

0.4

0.2 μM

Reverse Primer (10 μM)

1

0.4

0.2 μM

模板DNA

X

X

无菌超纯水

to 50

to 20

【注】: 使用前务必充分混匀,避免剧烈震荡产生过多气泡。

a) 引物浓度:通常引物终浓度为0.2 μM,也可以根据情况在0.1-1.0 μM之间进行调整。

b) 模板浓度:如模板类型为未稀释cDNA原液,使用体积不应超过qPCR反应总体积的1/10。

c) 模板稀释:cDNA原液建议5-10倍稀释,最佳模板加入量以扩增得到的CT值在20-30个循环为好。

d) 反应体系:推荐使用20 μl或50 μl,以保证目的基因扩增的有效性和重复性。

e) 体系配制:请于超净工作台内配制,并使用无核酸酶残留的枪头、反应管;推荐使用带滤芯的枪头。避免交叉污染和气溶胶污染。

 

     扩增程序(两步法)                           扩增程序(三步法)

循环步骤

温度

时间

循环数

 

循环步骤

温度

时间

循环数

预变性

95℃

30 sec

1

 

预变性

95℃

30 sec

1

变性

95℃

10 sec

40

 

变性

95℃

10 sec

40

退火/延伸

60℃

30 sec★

 

退火

55-60℃

20 sec

         

延伸

72℃

20 sec★

熔解曲线阶段

仪器默认设置

1

 

熔解曲线阶段

仪器默认设置

1

 

【注】高特异性可选择两步法,高效率扩增可选择三步法。

a) 预变性时间:本反应条件适合大多数基因扩增,如果遇到含有复杂结构的基因可适当增加预变性时间至3-5min。

b) 退火温度和时间:请根据引物和目的基因的长度进行调整。

c) 荧光信号采集(★):请按照仪器使用说明书要求进行实验程序设置,几种常见仪器的时间设定如下:

30sec以上:Applied Biosystems: StepOne, StepOne Plus, 7500 Fast;Roche Applied Science: LightCycler 480;Bio-Rad: CFX96

31sec以上:Applied Biosystems: 7300

34sec以上:Applied Biosystems: 7500

d) 熔解曲线:通常情况下可以使用仪器默认程序。

结果分析

定量实验至少需要三个生物学重复。反应结束后需要确认扩增曲线及熔解曲线。

1) 扩增曲线:标准扩增曲线为S型。

Ct值落在20-30之间时,定量分析最准确;

Ct值小于10,需要将稀释模板后,重新进行实验;

Ct值介于30-35之间时,需要提高模板浓度,或者增大反应体系的体积,以提高扩增效率,保证结果分析的准确性;
Ct值大于35时,检测结果无法定量分析基因的表达量,但可用于定性分析。

2) 熔解曲线:

熔解曲线单峰,表明反应特异性好可以进行定量结果分析;若熔解曲线出现双峰或者多峰,则不能进行定量分析。

熔解曲线出现双峰,需要通过DNA琼脂糖凝胶电泳判断非目标峰是引物二聚体还是非特异性扩增。

如果是引物二聚体,建议降低引物浓度,或者重新设计扩增效率高的引物。

如果是非特异性扩增,请提高退火温度,或者重新设计更高特异性的引物。

引物设计指南

1)推荐引物长度25 bp左右。扩增产物长度150 bp为佳,可以在100 bp-300 bp内选择。

2)正向引物和反向引物的Tm值相差不宜超过2℃。引物Tm值60℃-65℃为佳。

3)引物碱基分布要均匀,避免出现连续的4个相同碱基,GC含量控制在50%左右。3’端最后一个碱基最好为G或C。

4)引物内部或者正反两条引物间最好避免出现有3个碱基以上的互补序列。

5)引物特异性需要用NCBI BLAST程序进行核对。避免引物3’端有2个碱基以上的非特异性互补。

6)设计完成的引物需要进行扩增效率的检测,只有具备相同扩增效率的引物才可用于定量比较分析。

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货号

规格

Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis Kit(gDNA digester plus)

11121ES60

100 T

Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(gDNA digester plus) 

11123ES60

100 T

Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(No Rox )

11201ES08

5 mL

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11202ES08

5 mL

Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(High Rox Plus) 

11203ES08

5 mL

Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,No Rox)

11195ES08

5 mL

Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,Low Rox)

11196ES08

5 mL

Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox)

11197ES08

5 mL

Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,No Rox)

11198ES08

5 mL

Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,Low Rox)

11199ES08

5 mL

Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox)

11200ES08

5 mL

 

HB210824

Q:最近做相对定量实验,Ct 值一直在 30 以后,是否可以考虑用这一款产品?

A:可以,这款是高灵敏度的,针对低丰度样本开发优化的。

[1] Yan P, Li Z, Xiong J, et al. LARP7 ameliorates cellular senescence and aging by allosterically enhancing SIRT1 deacetylase activity. Cell Rep. 2021;37(8):110038. doi:10.1016/j.celrep.2021.110038(IF:9.423)
[2] Huang C, Zhang N, Xiong H, et al. Multi-Omics Analysis for Transcriptional Regulation of Immune-Related Targets Using Epigenetic Data: A New Research Direction. Front Immunol. 2022;12:741634. Published 2022 Jan 3. doi:10.3389/fimmu.2021.741634(IF:7.561)
[3] Ni Z, Huang C, Zhao H, et al. PLXNC1: A Novel Potential Immune-Related Target for Stomach Adenocarcinoma. Front Cell Dev Biol. 2021;9:662707. Published 2021 Jul 2. doi:10.3389/fcell.2021.662707(IF:6.684)
[4] Huang C, Huang R, Chen H, et al. Chromatin Accessibility Regulates Gene Expression and Correlates With Tumor-Infiltrating Immune Cells in Gastric Adenocarcinoma. Front Oncol. 2021;10:609940. Published 2021 Jan 5. doi:10.3389/fonc.2020.609940(IF:6.244)
[5] Wang Y, Chen Z, Zhang X, et al. Single-Base Resolution Mapping Reveals Distinct 5-Formylcytidine in Saccharomyces cerevisiae mRNAs. ACS Chem Biol. 2022;17(1):77-84. doi:10.1021/acschembio.1c00633(IF:5.100)
[6] Jian W, Deng XC, Munankarmy A, et al. KIF23 promotes triple negative breast cancer through activating epithelial-mesenchymal transition. Gland Surg. 2021;10(6):1941-1950. doi:10.21037/gs-21-19(IF:2.953)
[7] Lv J, Liu W, Shi G, et al. Human cardiac extracellular matrix-chitosan-gelatin composite scaffold and its endothelialization. Exp Ther Med. 2020;19(2):1225-1234. doi:10.3892/etm.2019.8349(IF:1.448)
[8] Cai Y, Zheng Q, Yao DJ. Phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 is a diagnostic and prognostic biomarker for hepatocellular carcinoma. World J Clin Cases. 2020;8(17):3774-3785. doi:10.12998/wjcc.v8.i17.3774(IF:1.013)