2×实时定量PCR扩增预混液|Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox)
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已发表文献
产品描述
本产品是2×实时定量PCR扩增的预混合溶液。采用的抗体法热启动DNA聚合酶(货号:10113ES),在预变性温度(95℃)加热30sec,UNICON® Taq抗体失活,释放出Taq DNA Polymerase活性。抗体法热启动Taq酶可以有效抑制引物非特异性退火导致的扩增。同时,配方优化了有效抑制非特异性PCR扩增的因子和提升PCR反应扩增效率的因子,适合低浓度模板的扩增,使定量PCR可以在宽广的定量区域内获得良好的标准曲线。
Mix中含有Hieff® Taq DNA Polymerase、UNICON® Taq抗体、SYBR Green I、dNTPs、Mg2+及High Rox。使用时,仅需在扩增体系中加入模板和引物即可进行实时荧光定量PCR,大大简化操作过程,降低污染几率。
适用机型
Applied Biosystems: 5700, 7000, 7300, 7700, 7900HT FAST, StepOne, StepOne Plus.
运输与保存方式
冰袋运输。-20℃避光储存,有效期18个月。
本品避免反复冻融。产品中含有荧光染料SYBR Green I,保存或配制反应体系时需避免强光照射。
注意事项
1. 解冻后Master Mix可能出现絮状物质,4℃放置并上下颠倒混匀至溶液澄清,不影响试剂性能。
2. 推荐使用本公司cDNA合成试剂盒(货号:11123ES),以有效去除RNA样品中残留的基因组。
3. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
4. 本产品仅作科研用途!
反应体系(推荐冰上配制)
组分 |
体积(μl) |
体积(μl) |
终浓度 |
Hieff UNICON® qPCR SYBR® Green Master Mix (抗体法,High Rox) |
25 |
10 |
1× |
Forward Primer (10 μM) |
1 |
0.4 |
0.2 μM |
Reverse Primer (10 μM) |
1 |
0.4 |
0.2 μM |
模板DNA |
X |
X |
– |
无菌超纯水 |
to 50 |
to 20 |
– |
【注】: 使用前务必充分混匀,避免剧烈震荡产生过多气泡。
a) 引物浓度:通常引物终浓度为0.2 μM,也可以根据情况在0.1-1.0 μM之间进行调整。
b) 模板浓度:如模板类型为未稀释cDNA原液,使用体积不应超过qPCR反应总体积的1/10。
c) 模板稀释:cDNA原液建议5-10倍稀释,最佳模板加入量以扩增得到的CT值在20-30个循环为好。
d) 反应体系:推荐使用20 μl或50 μl,以保证目的基因扩增的有效性和重复性。
e) 体系配制:请于超净工作台内配制,并使用无核酸酶残留的枪头、反应管;推荐使用带滤芯的枪头。避免交叉污染和气溶胶污染。
扩增程序(两步法) 扩增程序(三步法)
循环步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
循环步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
|
预变性 |
95℃ |
30 sec |
1 |
预变性 |
95℃ |
30 sec |
1 |
|
变性 |
95℃ |
10 sec |
40 |
变性 |
95℃ |
10 sec |
40 |
|
退火/延伸 |
60℃ |
30 sec★ |
退火 |
55-60℃ |
20 sec |
|||
延伸 |
72℃ |
20 sec★ |
||||||
熔解曲线阶段 |
仪器默认设置 |
1 |
熔解曲线阶段 |
仪器默认设置 |
1 |
【注】高特异性可选择两步法,高效率扩增可选择三步法。
a) 预变性时间:本反应条件适合大多数基因扩增,如果遇到含有复杂结构的基因可适当增加预变性时间至3-5min。
b) 退火温度和时间:请根据引物和目的基因的长度进行调整。
c) 荧光信号采集(★):请按照仪器使用说明书要求进行实验程序设置,几种常见仪器的时间设定如下:
30sec以上:Applied Biosystems: StepOne, StepOne Plus, 7500 Fast;Roche Applied Science: LightCycler 480;Bio-Rad: CFX96
31sec以上:Applied Biosystems: 7300
34sec以上:Applied Biosystems: 7500
d) 熔解曲线:通常情况下可以使用仪器默认程序。
结果分析
定量实验至少需要三个生物学重复。反应结束后需要确认扩增曲线及熔解曲线。
1) 扩增曲线:标准扩增曲线为S型。
Ct值落在20-30之间时,定量分析最准确;
Ct值小于10,需要将稀释模板后,重新进行实验;
Ct值介于30-35之间时,需要提高模板浓度,或者增大反应体系的体积,以提高扩增效率,保证结果分析的准确性;
Ct值大于35时,检测结果无法定量分析基因的表达量,但可用于定性分析。
2) 熔解曲线:
熔解曲线单峰,表明反应特异性好可以进行定量结果分析;若熔解曲线出现双峰或者多峰,则不能进行定量分析。
熔解曲线出现双峰,需要通过DNA琼脂糖凝胶电泳判断非目标峰是引物二聚体还是非特异性扩增。
如果是引物二聚体,建议降低引物浓度,或者重新设计扩增效率高的引物。
如果是非特异性扩增,请提高退火温度,或者重新设计更高特异性的引物。
引物设计指南
1)推荐引物长度25 bp左右。扩增产物长度150 bp为佳,可以在100 bp-300 bp内选择。
2)正向引物和反向引物的Tm值相差不宜超过2℃。引物Tm值60℃-65℃为佳。
3)引物碱基分布要均匀,避免出现连续的4个相同碱基,GC含量控制在50%左右。3’端最后一个碱基最好为G或C。
4)引物内部或者正反两条引物间最好避免出现有3个碱基以上的互补序列。
5)引物特异性需要用NCBI BLAST程序进行核对。避免引物3’端有2个碱基以上的非特异性互补。
6)设计完成的引物需要进行扩增效率的检测,只有具备相同扩增效率的引物才可用于定量比较分析。
相关产品
产品名称 |
货号 |
规格 |
Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis Kit(gDNA digester plus) |
11121ES60 |
100 T |
Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(gDNA digester plus) |
11123ES60 |
100 T |
Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(No Rox ) |
11201ES08 |
5 mL |
Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(Low Rox Plus) |
11202ES08 |
5 mL |
Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(High Rox Plus) |
11203ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,No Rox) |
11195ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,Low Rox) |
11196ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox) |
11197ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,No Rox) |
11198ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,Low Rox) |
11199ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox) |
11200ES08 |
5 mL |
HB210824
产品描述
本产品是2×实时定量PCR扩增的预混合溶液。采用的抗体法热启动DNA聚合酶(货号:10113ES),在预变性温度(95℃)加热30sec,UNICON® Taq抗体失活,释放出Taq DNA Polymerase活性。抗体法热启动Taq酶可以有效抑制引物非特异性退火导致的扩增。同时,配方优化了有效抑制非特异性PCR扩增的因子和提升PCR反应扩增效率的因子,适合低浓度模板的扩增,使定量PCR可以在宽广的定量区域内获得良好的标准曲线。
Mix中含有Hieff® Taq DNA Polymerase、UNICON® Taq抗体、SYBR Green I、dNTPs、Mg2+及High Rox。使用时,仅需在扩增体系中加入模板和引物即可进行实时荧光定量PCR,大大简化操作过程,降低污染几率。
适用机型
Applied Biosystems: 5700, 7000, 7300, 7700, 7900HT FAST, StepOne, StepOne Plus.
运输与保存方式
冰袋运输。-20℃避光储存,有效期18个月。
本品避免反复冻融。产品中含有荧光染料SYBR Green I,保存或配制反应体系时需避免强光照射。
注意事项
1. 解冻后Master Mix可能出现絮状物质,4℃放置并上下颠倒混匀至溶液澄清,不影响试剂性能。
2. 推荐使用本公司cDNA合成试剂盒(货号:11123ES),以有效去除RNA样品中残留的基因组。
3. 为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
4. 本产品仅作科研用途!
反应体系(推荐冰上配制)
组分 |
体积(μl) |
体积(μl) |
终浓度 |
Hieff UNICON® qPCR SYBR® Green Master Mix (抗体法,High Rox) |
25 |
10 |
1× |
Forward Primer (10 μM) |
1 |
0.4 |
0.2 μM |
Reverse Primer (10 μM) |
1 |
0.4 |
0.2 μM |
模板DNA |
X |
X |
– |
无菌超纯水 |
to 50 |
to 20 |
– |
【注】: 使用前务必充分混匀,避免剧烈震荡产生过多气泡。
a) 引物浓度:通常引物终浓度为0.2 μM,也可以根据情况在0.1-1.0 μM之间进行调整。
b) 模板浓度:如模板类型为未稀释cDNA原液,使用体积不应超过qPCR反应总体积的1/10。
c) 模板稀释:cDNA原液建议5-10倍稀释,最佳模板加入量以扩增得到的CT值在20-30个循环为好。
d) 反应体系:推荐使用20 μl或50 μl,以保证目的基因扩增的有效性和重复性。
e) 体系配制:请于超净工作台内配制,并使用无核酸酶残留的枪头、反应管;推荐使用带滤芯的枪头。避免交叉污染和气溶胶污染。
扩增程序(两步法) 扩增程序(三步法)
循环步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
循环步骤 |
温度 |
时间 |
循环数 |
|
预变性 |
95℃ |
30 sec |
1 |
预变性 |
95℃ |
30 sec |
1 |
|
变性 |
95℃ |
10 sec |
40 |
变性 |
95℃ |
10 sec |
40 |
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退火/延伸 |
60℃ |
30 sec★ |
退火 |
55-60℃ |
20 sec |
|||
延伸 |
72℃ |
20 sec★ |
||||||
熔解曲线阶段 |
仪器默认设置 |
1 |
熔解曲线阶段 |
仪器默认设置 |
1 |
【注】高特异性可选择两步法,高效率扩增可选择三步法。
a) 预变性时间:本反应条件适合大多数基因扩增,如果遇到含有复杂结构的基因可适当增加预变性时间至3-5min。
b) 退火温度和时间:请根据引物和目的基因的长度进行调整。
c) 荧光信号采集(★):请按照仪器使用说明书要求进行实验程序设置,几种常见仪器的时间设定如下:
30sec以上:Applied Biosystems: StepOne, StepOne Plus, 7500 Fast;Roche Applied Science: LightCycler 480;Bio-Rad: CFX96
31sec以上:Applied Biosystems: 7300
34sec以上:Applied Biosystems: 7500
d) 熔解曲线:通常情况下可以使用仪器默认程序。
结果分析
定量实验至少需要三个生物学重复。反应结束后需要确认扩增曲线及熔解曲线。
1) 扩增曲线:标准扩增曲线为S型。
Ct值落在20-30之间时,定量分析最准确;
Ct值小于10,需要将稀释模板后,重新进行实验;
Ct值介于30-35之间时,需要提高模板浓度,或者增大反应体系的体积,以提高扩增效率,保证结果分析的准确性;
Ct值大于35时,检测结果无法定量分析基因的表达量,但可用于定性分析。
2) 熔解曲线:
熔解曲线单峰,表明反应特异性好可以进行定量结果分析;若熔解曲线出现双峰或者多峰,则不能进行定量分析。
熔解曲线出现双峰,需要通过DNA琼脂糖凝胶电泳判断非目标峰是引物二聚体还是非特异性扩增。
如果是引物二聚体,建议降低引物浓度,或者重新设计扩增效率高的引物。
如果是非特异性扩增,请提高退火温度,或者重新设计更高特异性的引物。
引物设计指南
1)推荐引物长度25 bp左右。扩增产物长度150 bp为佳,可以在100 bp-300 bp内选择。
2)正向引物和反向引物的Tm值相差不宜超过2℃。引物Tm值60℃-65℃为佳。
3)引物碱基分布要均匀,避免出现连续的4个相同碱基,GC含量控制在50%左右。3’端最后一个碱基最好为G或C。
4)引物内部或者正反两条引物间最好避免出现有3个碱基以上的互补序列。
5)引物特异性需要用NCBI BLAST程序进行核对。避免引物3’端有2个碱基以上的非特异性互补。
6)设计完成的引物需要进行扩增效率的检测,只有具备相同扩增效率的引物才可用于定量比较分析。
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产品名称 |
货号 |
规格 |
Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis Kit(gDNA digester plus) |
11121ES60 |
100 T |
Hifair® II 1st Strand cDNA Synthesis SuperMix for qPCR(gDNA digester plus) |
11123ES60 |
100 T |
Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(No Rox ) |
11201ES08 |
5 mL |
Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(Low Rox Plus) |
11202ES08 |
5 mL |
Hieff® qPCR SYBR® Green Master Mix(High Rox Plus) |
11203ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,No Rox) |
11195ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,Low Rox) |
11196ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® Power qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox) |
11197ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,No Rox) |
11198ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,Low Rox) |
11199ES08 |
5 mL |
Hieff UNICON® qPCR SYBR Green Master Mix(抗体法,High Rox) |
11200ES08 |
5 mL |
HB210824
Q:最近做相对定量实验,Ct 值一直在 30 以后,是否可以考虑用这一款产品?
A:可以,这款是高灵敏度的,针对低丰度样本开发优化的。
[1] Yan P, Li Z, Xiong J, et al. LARP7 ameliorates cellular senescence and aging by allosterically enhancing SIRT1 deacetylase activity. Cell Rep. 2021;37(8):110038. doi:10.1016/j.celrep.2021.110038(IF:9.423)
[2] Huang C, Zhang N, Xiong H, et al. Multi-Omics Analysis for Transcriptional Regulation of Immune-Related Targets Using Epigenetic Data: A New Research Direction. Front Immunol. 2022;12:741634. Published 2022 Jan 3. doi:10.3389/fimmu.2021.741634(IF:7.561)
[3] Ni Z, Huang C, Zhao H, et al. PLXNC1: A Novel Potential Immune-Related Target for Stomach Adenocarcinoma. Front Cell Dev Biol. 2021;9:662707. Published 2021 Jul 2. doi:10.3389/fcell.2021.662707(IF:6.684)
[4] Huang C, Huang R, Chen H, et al. Chromatin Accessibility Regulates Gene Expression and Correlates With Tumor-Infiltrating Immune Cells in Gastric Adenocarcinoma. Front Oncol. 2021;10:609940. Published 2021 Jan 5. doi:10.3389/fonc.2020.609940(IF:6.244)
[5] Wang Y, Chen Z, Zhang X, et al. Single-Base Resolution Mapping Reveals Distinct 5-Formylcytidine in Saccharomyces cerevisiae mRNAs. ACS Chem Biol. 2022;17(1):77-84. doi:10.1021/acschembio.1c00633(IF:5.100)
[6] Jian W, Deng XC, Munankarmy A, et al. KIF23 promotes triple negative breast cancer through activating epithelial-mesenchymal transition. Gland Surg. 2021;10(6):1941-1950. doi:10.21037/gs-21-19(IF:2.953)
[7] Lv J, Liu W, Shi G, et al. Human cardiac extracellular matrix-chitosan-gelatin composite scaffold and its endothelialization. Exp Ther Med. 2020;19(2):1225-1234. doi:10.3892/etm.2019.8349(IF:1.448)
[8] Cai Y, Zheng Q, Yao DJ. Phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate dependent Rac exchange factor 1 is a diagnostic and prognostic biomarker for hepatocellular carcinoma. World J Clin Cases. 2020;8(17):3774-3785. doi:10.12998/wjcc.v8.i17.3774(IF:1.013)