PCR Master Mix高保真酶预混液 2×高保真DNA聚合酶预混合溶液

PCR Master Mix高保真酶预混液 2×高保真DNA聚合酶预混合溶液

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产品描述

2× Hieff Canace® PCR Master Mix是即用型2×预混合溶液,包含Hieff Canace® High-Fidelity DNA Polymerase,dNTP以及优化的缓冲体系。Hieff Canace® High-Fidelity DNA Polymerase是新一代的高保真DNA聚合酶,具有5’→3’DNA聚合酶活性和3’→5’核酸外切酶活性,其保真性是Taq DNA聚合酶的52倍,是普通Pfu DNA聚合酶的6倍。扩增速度可达15 sec/kb。适用于复杂模板的扩增,扩增产物为平末端。

2× Hieff Canace® PCR Master Mix具有快速简便、灵敏度高、特异性强、稳定性好等优点,反应体系只需加入引物和模板即可进行扩增,简化了实验操作步骤,减少了人为误差,提高了实验通量和结果的重复性。本产品中不含染料,PCR产物需加入Loading buffer 后进行电泳。另外,该产品还含有特异保护剂,使得预混液反复冻融后仍可维持稳定活性。
 

产品应用

基因克隆;复杂DNA模板扩增;高通量建库。
 

运输与保存方法

冰袋运输。-20℃保存。有效期2年。

注意事项

1)为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
2)本产品仅作科研用途!

 

推荐PCR反应体系(冰上配制)

组分

体积

终浓度

ddH2O

to 50 μL

DNA模板

适量

Primer正向 (10 μM)

2.5 μL

0.5 μM

Primer反向 (10 μM)

2.5 μL

0.5 μM

2× Hieff Canace® PCR Master Mix

25 μL

【注】:
1)聚合酶终浓度:在1×预混液含有1 U/50 μL的聚合酶。
2)引物:PCR反应体系中引物终浓度的范围为0.2-1 μM,推荐0.5 μM。
3)Mg2+、dNTP终浓度:在1×预混液含有1.5 mM Mg2+和200 μM的dNTP。
4)高GC模板:在体系中加入终浓度为3%的DMSO可能有利于扩增。
5)不同模板的推荐使用量(50 μL反应体系):

模板种类

扩增片段1 kb-20 kb

基因组DNA

50 ng-200 ng

质粒或病毒DNA

10 pg-20 ng

cDNA

1-5 μL (不超过PCR反应总体积的1/10)

PCR扩增程序设置

循环步骤

温度

时间

循环数

预变性

98℃

0.5-3 min

1

变性

98℃

10 sec

30-35

退火

60℃

20 sec

延伸

72℃

15-30 sec/kb

终延伸

72℃

5 min

1

【注】:
1)预变性温度和时间:推荐使用98℃。预变性推荐时间:质粒DNA等简单模板为30 sec;cDNA、基因组DNA等复杂模板为3 min;高GC含量模板为5-10 min。
2)退火温度和时间:推荐使用60℃,也可根据需要,设立温度梯度去摸索引物退火的最适温度。推荐退火时间设置为20 sec,可以在10-30 sec内调节。退火时间太长可能导致扩增产物在胶上呈弥散状。
3)延伸温度和时间:推荐使用72℃。延伸时间推荐如下:质粒DNA等简单模板为15 sec/kb;cDNA、基因组DNA等复杂模板为30 sec/kb,根据实际情况可延长至40 sec/kb。
4)扩增产物:请将PCR扩增产物放置于-20℃保存,防止该酶降解扩增产物。扩增产物为平末端,产物直接用于克隆,请使用平末端连接载体。

 

应用实例

PCR Master Mix高保真酶预混液 2×高保真DNA聚合酶预混合溶液

图1: Hieff Canace® 高保真PCR预混液扩增2.1 kb-6 kb目的片段。所有基因片段均可实现高特异性、高产量扩增。模板:拟南芥基因组DNA,50 ng/50 μL;退火温度:60℃;延伸时间:30 sec/kb。M:1 kb ladder; 1:2.1 kb;2:3.1 kb;3:4.2 kb;4:5 kb;5:6 kb。

相关产品

产品名称

货号

规格

Hieff Canace® High-Fidelity DNA Polymerase 高保真DNA聚合酶

10135ES60/76/80

100/500/1000 U

零背景TOPO-TA克隆试剂盒HOT

10907ES20

20 T

零背景TOPO-TA克隆试剂盒(不含MCS多克隆酶切位点)

10908ES20

20 T

零背景TOPO-Blunt平末端克隆试剂盒HOT

10909ES20

20 T

零背景TOPO-Blunt平末端克隆试剂盒(不含MCS多克隆酶切位点)

10910ES20

20 T

一步法快速克隆试剂盒HOT

10911ES20

20 T

多片段一步法快速克隆试剂盒HOT

10912ES10

10 T

定点突变试剂盒HOT

11003ES10

10 T

多点突变试剂盒HOT

11004ES10

10 T

 HB210831

 

Q:Canace 具有保真性的原理是?错配率是多少?能保证不突变吗?

A:  a)原理是具有 3’-5’的核酸外切酶活性,即有校正功能。

bTaq 酶错配率:2*1040.0002,大约5kb 有一个碱基发生突变。Canace 0.00039%, taq 酶的 52 倍。

c)高保真酶是突变概率低,但不是绝对的不突变。

Q:Canace 扩增后是平末端产物,如何加 A 尾?

A仅供参考:先对平末端PCR 产物纯化后,浓度要求至少 20ng/ ul(跑胶图像条带清晰,明亮即可,取 14.5 ul PCR 产物,加入 2 ul Taq Buffer3ul dNTP0.5 ul Taq酶,在 72℃反应 10~20min, 后直接回收纯化加A 尾的DNA 片段。

Q:Canace 能否用于 XX 长度的片段?

A验证范围内长度理论上是可以的(验证范围:简单模板 20kb,复杂模板 10kb。但具体能否扩出,还与模板和引物等有关。

Q:产物突变?

A原因 1:模板突变。 1.原始模板序列有突变。

原因:原始模板序列有突变会使扩增产物的突变位点恒定,表现在多个克隆测序发生突变,且突变位置恒定。

判断方法:将模板与 T 载体连接产生的克隆送测序,测序结果与模板序列对比,发生突变且位置恒定,可认为是模板序列发生突变。

优化方法:更换序列正确的模板。

2.保存不当突变。

原因:反复冻融或长时间紫外照射可能导致模板发生断裂或突变,突变位置不定。

判断方法:将模板与 T 载体连接产生的克隆送测序,测序结果与模板序列对比,发生突变且位置不定,可认为是因保存不当导致模板发生了突变。

优化方法:尽量减少模板的反复冻融或紫外照射。原因 2:酶保真性差。

DNA 聚合酶保真性差,导致突变的概率大,在长片段扩增中更常见。

判断方法:将模板与 T 载体连接产生的克隆送测序,模板不突变。以模板扩增得到的产物进行克隆测序后发生突变,且突变位置不恒定,可认为是 PCR 过程中发生的突变, 常是由于酶保真性差导致。

优化方法:更换成保真性更高的产品。注:保真性高低代表突变概率的高低,保真性再高的产品均不能完全避免突变。

[1] Zhang Q, Xie Z, Zhang R, et al. Blue Light Regulates Secondary Cell Wall Thickening via MYC2/MYC4 Activation of the NST1-Directed Transcriptional Network in Arabidopsis. Plant Cell. 2018;30(10):2512-2528. doi:10.1105/tpc.18.00315(IF:8.228)
[2] Chen JJ, You XJ, Li L, et al. Single-Base Resolution Detection of Adenosine-to-Inosine RNA Editing by Endonuclease-Mediated Sequencing. Anal Chem. 2022;94(24):8740-8747. doi:10.1021/acs.analchem.2c01226(IF:6.986)

产品描述

2× Hieff Canace® PCR Master Mix是即用型2×预混合溶液,包含Hieff Canace® High-Fidelity DNA Polymerase,dNTP以及优化的缓冲体系。Hieff Canace® High-Fidelity DNA Polymerase是新一代的高保真DNA聚合酶,具有5’→3’DNA聚合酶活性和3’→5’核酸外切酶活性,其保真性是Taq DNA聚合酶的52倍,是普通Pfu DNA聚合酶的6倍。扩增速度可达15 sec/kb。适用于复杂模板的扩增,扩增产物为平末端。

2× Hieff Canace® PCR Master Mix具有快速简便、灵敏度高、特异性强、稳定性好等优点,反应体系只需加入引物和模板即可进行扩增,简化了实验操作步骤,减少了人为误差,提高了实验通量和结果的重复性。本产品中不含染料,PCR产物需加入Loading buffer 后进行电泳。另外,该产品还含有特异保护剂,使得预混液反复冻融后仍可维持稳定活性。
 

产品应用

基因克隆;复杂DNA模板扩增;高通量建库。
 

运输与保存方法

冰袋运输。-20℃保存。有效期2年。

注意事项

1)为了您的安全和健康,请穿实验服并佩戴一次性手套操作。
2)本产品仅作科研用途!

 

推荐PCR反应体系(冰上配制)

组分

体积

终浓度

ddH2O

to 50 μL

DNA模板

适量

Primer正向 (10 μM)

2.5 μL

0.5 μM

Primer反向 (10 μM)

2.5 μL

0.5 μM

2× Hieff Canace® PCR Master Mix

25 μL

【注】:
1)聚合酶终浓度:在1×预混液含有1 U/50 μL的聚合酶。
2)引物:PCR反应体系中引物终浓度的范围为0.2-1 μM,推荐0.5 μM。
3)Mg2+、dNTP终浓度:在1×预混液含有1.5 mM Mg2+和200 μM的dNTP。
4)高GC模板:在体系中加入终浓度为3%的DMSO可能有利于扩增。
5)不同模板的推荐使用量(50 μL反应体系):

模板种类

扩增片段1 kb-20 kb

基因组DNA

50 ng-200 ng

质粒或病毒DNA

10 pg-20 ng

cDNA

1-5 μL (不超过PCR反应总体积的1/10)

PCR扩增程序设置

循环步骤

温度

时间

循环数

预变性

98℃

0.5-3 min

1

变性

98℃

10 sec

30-35

退火

60℃

20 sec

延伸

72℃

15-30 sec/kb

终延伸

72℃

5 min

1

【注】:
1)预变性温度和时间:推荐使用98℃。预变性推荐时间:质粒DNA等简单模板为30 sec;cDNA、基因组DNA等复杂模板为3 min;高GC含量模板为5-10 min。
2)退火温度和时间:推荐使用60℃,也可根据需要,设立温度梯度去摸索引物退火的最适温度。推荐退火时间设置为20 sec,可以在10-30 sec内调节。退火时间太长可能导致扩增产物在胶上呈弥散状。
3)延伸温度和时间:推荐使用72℃。延伸时间推荐如下:质粒DNA等简单模板为15 sec/kb;cDNA、基因组DNA等复杂模板为30 sec/kb,根据实际情况可延长至40 sec/kb。
4)扩增产物:请将PCR扩增产物放置于-20℃保存,防止该酶降解扩增产物。扩增产物为平末端,产物直接用于克隆,请使用平末端连接载体。

 

应用实例

PCR Master Mix高保真酶预混液 2×高保真DNA聚合酶预混合溶液

图1: Hieff Canace® 高保真PCR预混液扩增2.1 kb-6 kb目的片段。所有基因片段均可实现高特异性、高产量扩增。模板:拟南芥基因组DNA,50 ng/50 μL;退火温度:60℃;延伸时间:30 sec/kb。M:1 kb ladder; 1:2.1 kb;2:3.1 kb;3:4.2 kb;4:5 kb;5:6 kb。

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产品名称

货号

规格

Hieff Canace® High-Fidelity DNA Polymerase 高保真DNA聚合酶

10135ES60/76/80

100/500/1000 U

零背景TOPO-TA克隆试剂盒HOT

10907ES20

20 T

零背景TOPO-TA克隆试剂盒(不含MCS多克隆酶切位点)

10908ES20

20 T

零背景TOPO-Blunt平末端克隆试剂盒HOT

10909ES20

20 T

零背景TOPO-Blunt平末端克隆试剂盒(不含MCS多克隆酶切位点)

10910ES20

20 T

一步法快速克隆试剂盒HOT

10911ES20

20 T

多片段一步法快速克隆试剂盒HOT

10912ES10

10 T

定点突变试剂盒HOT

11003ES10

10 T

多点突变试剂盒HOT

11004ES10

10 T

 HB210831

 

Q:Canace 具有保真性的原理是?错配率是多少?能保证不突变吗?

A:  a)原理是具有 3’-5’的核酸外切酶活性,即有校正功能。

bTaq 酶错配率:2*1040.0002,大约5kb 有一个碱基发生突变。Canace 0.00039%, taq 酶的 52 倍。

c)高保真酶是突变概率低,但不是绝对的不突变。

Q:Canace 扩增后是平末端产物,如何加 A 尾?

A仅供参考:先对平末端PCR 产物纯化后,浓度要求至少 20ng/ ul(跑胶图像条带清晰,明亮即可,取 14.5 ul PCR 产物,加入 2 ul Taq Buffer3ul dNTP0.5 ul Taq酶,在 72℃反应 10~20min, 后直接回收纯化加A 尾的DNA 片段。

Q:Canace 能否用于 XX 长度的片段?

A验证范围内长度理论上是可以的(验证范围:简单模板 20kb,复杂模板 10kb。但具体能否扩出,还与模板和引物等有关。

Q:产物突变?

A原因 1:模板突变。 1.原始模板序列有突变。

原因:原始模板序列有突变会使扩增产物的突变位点恒定,表现在多个克隆测序发生突变,且突变位置恒定。

判断方法:将模板与 T 载体连接产生的克隆送测序,测序结果与模板序列对比,发生突变且位置恒定,可认为是模板序列发生突变。

优化方法:更换序列正确的模板。

2.保存不当突变。

原因:反复冻融或长时间紫外照射可能导致模板发生断裂或突变,突变位置不定。

判断方法:将模板与 T 载体连接产生的克隆送测序,测序结果与模板序列对比,发生突变且位置不定,可认为是因保存不当导致模板发生了突变。

优化方法:尽量减少模板的反复冻融或紫外照射。原因 2:酶保真性差。

DNA 聚合酶保真性差,导致突变的概率大,在长片段扩增中更常见。

判断方法:将模板与 T 载体连接产生的克隆送测序,模板不突变。以模板扩增得到的产物进行克隆测序后发生突变,且突变位置不恒定,可认为是 PCR 过程中发生的突变, 常是由于酶保真性差导致。

优化方法:更换成保真性更高的产品。注:保真性高低代表突变概率的高低,保真性再高的产品均不能完全避免突变。

[1] Zhang Q, Xie Z, Zhang R, et al. Blue Light Regulates Secondary Cell Wall Thickening via MYC2/MYC4 Activation of the NST1-Directed Transcriptional Network in Arabidopsis. Plant Cell. 2018;30(10):2512-2528. doi:10.1105/tpc.18.00315(IF:8.228)
[2] Chen JJ, You XJ, Li L, et al. Single-Base Resolution Detection of Adenosine-to-Inosine RNA Editing by Endonuclease-Mediated Sequencing. Anal Chem. 2022;94(24):8740-8747. doi:10.1021/acs.analchem.2c01226(IF:6.986)