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Carboxypeptidase B
羧肽酶B
I.U.B.: 3.4.17.2
C.A.S.: 9025-24-5
羧肽酶B（CPDB）是金属羧基肽酶，其催化从多肽的C-末端位置碱解氨基酸，赖氨酸，精氨酸和鸟氨酸的水解：
肽基-L-赖氨酸（-L-碱性氨基酸）+ H 2 O→肽+ L-赖氨酸（L-碱性氨基酸）
羧肽酶由胰腺的腺泡细胞分泌为酶原。酶在胰岛素被小肠激活。
历史：
1931年，Waldschmidt-Leitz 等 证明猪胰腺排泄物含有催化精氨酸从蛋白质释放的酶（Folk 1971）。他们称之为酶“protaminase”。在1933年，Calvery使用蛋白清蛋白来表明它也可能对这种酶敏感，表明赖氨酸和组氨酸也可以释放。在整个20世纪30年代和40年代，据信这种酶与糜蛋白酶相同（Sumner和Somers 1947和Northrop等人， 1948）。
在1940年，霍夫曼和伯格曼的工作表明赖氨酸只是在羧肽酶A（CPDA）存在下从底物缓慢释放出来。Folk在1956年的作品表明赖氨酸在市售的胰脏粉末（Folk 1971）的存在下迅速释放。这两个见解导致实验证实存在两种单独的羧肽酶（Folk 1956，Folk和Gladner 1958）。羧肽酶B名称由Folk 等人 于1960年将其与CPDA区分开来。
1975年，Titani 等人 确定氨基酸序列。1976年，施密德和赫里奥科特将结构解析为一个2.8Å分辨率，后来被Coll 等人完善。胰腺猪pro-CPDB前段的球状结构域是由Vendrell 等人的 NMR光谱学衍生的。在1990年。
zui近的工作包括获得CPDB的更高分辨率晶体结构（Fernández 等， 2010），以及解决有效的硫醇抑制剂的晶体结构（Adler 等， 2005）。
特异性：
CPDB由胰蛋白酶激活。CPDB对赖氨酸和精氨酸是高度特异性的，但显示出对精氨酸的偏好（Tan和Eaton 1995）。它也可以对缬氨酸，亮氨酸，异亮氨酸，天冬酰胺，甘氨酸和谷氨酰胺起作用（速度较慢）（Villegas等， 1995，Nishihira 等， 1995）。与CPDA中的Gly207，Ile243和Ile255相比，羧肽酶A（CPDA）和CPDB之间的特异性差异可归因于CPDB中的残基Ser205，Gly241和Asp253（Coll 等人， 1991）。
分子特征：
Clauser 等人 研究了大鼠前羧肽酶B基因，发现它与牛CPB1 基因非常相似（Clauser 等，1988）。该CPB1 基因在许多真核生物中是保守的，在人类，黑猩猩，狗，小鼠，大鼠，鸡，斑马鱼进行了研究，并果蝇（阿维莱斯和2004年本德雷利）。大鼠CPDB的成熟形式与牛CPDB（77％相同）同源，参与催化或配体结合的氨基酸显示无差异。前羧肽酶B的编码区由11个外显子组成（Clauser 等，1988）。大鼠CPDB ，大鼠CPDA 和大鼠CPDA2的比较 基因已经表明，尽管间插序列存在很大差异，但外显子的数目，位置和序列组成是保守的（Gardell 等人，1988，和Clauser 等，1988）。通过cDNA和mRNA测序，CPDB mRNA已被确定为1385个核苷酸，不包括poly（A）尾。大鼠CPDB mRNA比CPDA mRNA长100个核苷酸。这种差异主要是由于CPDB mRNA中3'非翻译区（UTR）较大（Han等，1986）。
组成：
CPDB的主要形式是单体状态。CPDB每摩尔蛋白质含有1个锌原子。配位锌残基的残基是保守的，包括两个组氨酸，谷氨酸和水（Avilés和Vendrell，2004）。
蛋白质登录号： P09955
CATH分类（v。3.2.0）：
- 类：Alpha Beta
- 建筑：3层（aba）三明治
- 拓扑：氨肽酶
分子量：
- 34.3 kDa（Folk et al。， 1960）
- 34.7 kDa（理论）
*pH： 9.0（Wolff 等 1962）
等电点： 4.6-5.2（Lipperheide和Otto 1986）
消光系数：
- 77,080 -1 M -1 （理论值）
- E 1％，280 = 21.4（Folk 1971）
活性残留物：
- 谷氨酸（E378）
- 酪氨酸（Y356）
抑制剂：
- 由精氨酸，赖氨酸和鸟氨酸竞争性抑制（Wolff 等 1962）
- 金属螯合剂如1,10-菲咯啉和EDTA
- 重金属
- Not inhibited by diisopropylfluorophosphate (DFP) or phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF)
- 马铃薯羧肽酶抑制剂（Hass 等， 1981）
- 水蛭羧肽酶抑制剂（Reverter 等人 1998）
应用：
- 通过连续切割C末端碱性氨基酸进行序列分析
- 急性胰腺炎诊断的血清标记物（Avilés和Vendrell 2004）
- 细胞色素C逐步消化（苏迪等人 1989）
- 人胰岛素生产（Ladisch和Kohlmann，1992）